A Horizont 2020 struktúrájában a három fő pillérén kívül, külön akcióként szerepelnek a
Előbbi a tudomány és a társadalom közti kapcsolatok fejlesztését, utóbbi a kevésbé fejlett kutatás-fejlesztési és innovációs rendszerű régiók kiválóságának erősítését szolgálja.
Az EU-s szakpolitikák tudományos igényű megalapozásában kiemelkedő szerepet játszik a Horizont 2020 költségvetéséből közvetlen finanszírozásban részesülő Közös Kutatóközpont (Joint Research Centre), amely kiterjedt kutatóintézeti hálózatot működtet az EU különböző tagállamaiban.
A Horizont 2020 Keretprogram rendszerébe ágyazódva, jelentős költségvetési növekménnyel működik tovább az Európai Innovációs és Technológiai Intézet, melyek fő feladata az oktatás – kutatás – innováció (gyakorlati alkalmazás) közötti szinergiák megteremtése.
A Horizont 2020 Kutatási és Innovációs Keretprogram átfogó szabályozó szerkezetéből adódóan egységes részvételi rendszerbe foglalja, valamint társfinanszírozást nyújt a különböző tagállamok, a vezető ipari vállalatok között létrejövő együttműködési formáknak. A különböző témaspecifikus kooperációk tovább bővítik a pályázható források palettáját.
A Közös Technológiai Kezdeményezések (JTI) az Európai Unió működéséről szóló szerződés 187. cikkén alapuló köz és magánszféra között létrejött együttműködés, melynek célja az összehangolt kutatási tevékenység ösztönzése az alábbi tématerületeken:
A Európai Unió működéséről szóló szerződés 185. cikkén alapuló Közös programok a tagállamok együttműködését, koncentrált finanszírozási modelljét teszi lehetővé az alábbi területeken:
A Közös Programozási Kezdeményezések (Joint Programming Initiatives) a tagállami közfinanszírozású kutatási programok közötti kooperációt hivatott elősegíteni 10 tématerületen.
Az ERA-NET COFUND konstrukció célja a Horizont 2020 keretprogramban a köz-és magánszféra közötti partnerségek támogatása (beleértve a közös programozási kezdeményezéseket).
A köz és a magánszféra közötti társulások (Public-Private Partnerships) célja az európai termelés kulcságazataiban történő kutatás támogatása az állami és a magánszektor azonos arányú támogatásával.